Karl Heyer wurde 1888 in Hanau (Hessen) geboren, mütterlicherseits von ausgewanderten Hugenotten abstammend. 1907 studierte er in Genf Jura. 1911 hörte er den ersten Vortrag R. Steiners und begann noch ein Geschichtsstudium zu absolvieren.
Karl Heyer verfasste das neunbändige Werk Beiträge zur Geschichte des Abendlandes, das er mit dem Buch über Kaspar Hauser abschloss.
Er starb am 24. Juli 1964 in Freiburg i. Breisgau.